Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpd52Q62393 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms