Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms