Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctr9Q62018 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctr9Q62018 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctr9Q62018 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctr9Q62018 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctr9Q62018 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctr9Q62018 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms