Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Odf1Q61999 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Odf1Q61999 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Odf1Q61999 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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