Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp2Q61990 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcbp2Q61990 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms