Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna2Q61301 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna2Q61301 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms