Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Clns1aQ61189 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clns1aQ61189 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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