Protein–RNA interactions for Protein: Q61129

Cfi, Complement factor I, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfiQ61129 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CfiQ61129 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CfiQ61129 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms