Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbbp7Q60973 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms