Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lmtk3Q5XJV6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmtk3Q5XJV6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms