Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms