Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc11Q5U458 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc11Q5U458 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms