Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med13Q5SWW4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms