Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf145Q5SWK7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf145Q5SWK7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms