Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r195Q5SVD6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms