Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psme4Q5SSW2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms