Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms