Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf12Q5SPL2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf12Q5SPL2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms