Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Brsk1Q5RJI5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brsk1Q5RJI5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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