Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms