Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa23Q5G866 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms