Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761185Q5ERI8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AY761185Q5ERI8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms