Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q5EBG8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5EBG8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms