Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl5Q5DTT4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms