Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn34b4Q3V0X2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34b4Q3V0X2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn34b4Q3V0X2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms