Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc43Q3V0L5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc43Q3V0L5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms