Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm6Q3UZD5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms