Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc114Q3UX62 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms