Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn4Q3UWL8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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