Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chpf2Q3UU43 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms