Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms