Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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D13Ertd608eQ3UPR8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms