Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc4Q3UP44 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms