Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd27Q3UMR0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms