Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms