Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsg1Q3UM18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms