Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx27Q3UHD6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx27Q3UHD6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms