Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms