Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms