Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf180Q3U827 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Rnf180Q3U827 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Rnf180Q3U827 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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Rnf180Q3U827 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rnf180Q3U827 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rnf180Q3U827 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf180Q3U827 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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