Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms