Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbtb38Q3LR78 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbtb38Q3LR78 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms