Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap9Q1HDU4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms