Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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