Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp2b3Q0VF55 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms