Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd12Q0VE29 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms