Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pate4Q09098 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pate4Q09098 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms