Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Plac8l1Q08EJ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Plac8l1Q08EJ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms