Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms