Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CbfbQ08024 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms